2023年12月6日，空間多組學被Nature Methods雜志評選為2023年度最值得期待的技術之一，是繼2022年被Nature雜志稱為最值得期待的技術之一后再獲年度殊榮！
圖 1. Nature Method文章截圖
隨著生物體發(fā)展進化過程，空間信息的缺乏往往使得單個細胞在組織中如何執(zhí)行功能無法被揭示，因此分析胞內(nèi)的功能狀態(tài)對胞外及周圍環(huán)境顯得格外必要。先進的空間多組學可以幫助識別新的細胞亞型，局部觀察細胞內(nèi)和細胞間分子相互作用。從染色質到表型，從DNA到代謝，多組學方法旨在聯(lián)合基因組、表觀組、蛋白質組及代謝組的信息，拓寬我們對機制關系的認識，揭示細胞功能所必需的分子作用，構建可持續(xù)發(fā)展的疾病精準醫(yī)療方案。
空間多組學技術全面助力人類組織圖譜解析
今年 6 月份，Nature發(fā)布迄今為止最詳細、最全面的人類乳腺細胞圖譜，空間多組學技術全面助力人類組織圖譜解析。研究利用單細胞/單核/空間轉錄組和多重免疫組化（mIHC）技術鑒定出人類 12 種主要的細胞類型，描繪 58 種不同的細胞狀態(tài)，并對具體的細胞類型和細胞間的相互作用進一步解析，詳細描繪乳腺組織中各細胞亞型的細胞狀態(tài)和空間聯(lián)絡，為深入理解乳腺組織的解剖生物學特征和疾病治療提供全面的理論依據(jù)。
圖 2.乳腺組織中主要細胞類型的空間組學分析
艾克發(fā)生物mIHC和RNA-ISH強強聯(lián)合
RNA 和蛋白的空間分布對于確定蛋白質在組織中的準確定位和功能至關重要，其可隨著細胞類型、細胞周期進展、疾病狀態(tài)和診療方法的變化而改變。通過不同組學實現(xiàn)生物標志物與空間位置的一一對應，獲得更高維度和更高分辨率的表達圖譜，全面解析組織微環(huán)境，以便提供精確診斷和治療的方案。
艾克發(fā)生物于12月初推出AlphaXISH® 新一代RNA 原位雜交試劑盒后，升級mIHC方案，實現(xiàn) mIHC和RNA-ISH兩大技術強強聯(lián)合，可在同一張切片上可同時獲得 RNA 和蛋白水平的原位信息，單細胞分辨率下檢測、表征和分析，獲得真正的空間多組學信息，詳細展示細胞鄰域和組織微環(huán)境，在真實的組織空間背景下深入洞察細胞間相互作用、細胞通訊和細胞狀態(tài)，發(fā)現(xiàn)有關腫瘤問題的關鍵機制，從而實現(xiàn)在臨床上的大規(guī)模應用。
該方案可應用于腫瘤免疫、神經(jīng)科學、細胞和基因治療、傳染病、炎癥等領域，檢測靶細胞中的非編碼 RNA，識別分泌蛋白的細胞來源，檢測特定細胞的高度同源轉錄本、可變剪接體等，進行RNA-蛋白表達相關性分析等。
圖3. 單細胞原位空間多組學整體解決方案
圖 4. RNA 雙標 + 蛋白三標共染視野圖
